Kluczem do naliczenia wynagrodzenia chorobowego jest zawsze ustalenie jego podstawy. Podstawą wynagrodzenia chorobowego, czy też zasiłku chorobowego jest średnie wynagrodzenie brutto pracownika uzyskane za okres 12 miesięcy poprzedzających miesiąc choroby, umniejszone o składki ZUS finansowane przez pracownika (13,71%). Uzyskaną w ten sposób kwotę należy podzielić przez 31 dni, przemnożyć przez liczbę dni choroby oraz przez 100% (jeżeli niedyspozycja spowodowana jest ciążą, wypadkiem w pracy lub poddaniem się badaniom i zabiegom na dawcą komórek, narządów i tkanek) lub 80% (w każdym innym przypadku). Uzyskany wynik stanowi kwotę wynagrodzenia / zasiłku chorobowego brutto. W przypadku wynagrodzenia chorobowego kwotę brutto należy umniejszyć o składkę zdrowotną (9%) oraz podatek dochodowy od osób fizycznych (18%). Natomiast zasiłek chorobowy tym różni się od wynagrodzenia chorobowego, że aby uzyskać kwotę netto świadczenia, należy odliczyć wyłącznie podatek dochodowy (18%).
